MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw5 genomic sequence

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020267	AGGCC	2	10	222	231	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020267	T	6	6	247	252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020267	ATA	2	6	254	259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020267	TTGA	2	8	488	495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020267	A	7	7	522	528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020267	A	6	6	540	545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020267	TAT	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020267	CATT	2	8	3309	3316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020267	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020267	CAT	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020267	AGG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020267	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020267	AGT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020267	TAT	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020267	TAA	2	6	5964	5969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020267	T	6	6	5991	5996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020267	A	6	6	6013	6018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020267	ATG	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020267	AGC	2	6	6383	6388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020267	TCT	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020267	TAAA	2	8	6590	6597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020267	A	6	6	6595	6600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020267	TAA	3	9	7632	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020267	TTC	2	6	7679	7684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020267	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020267	TAT	2	6	7708	7713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020267	T	6	6	7730	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020267	CTA	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020267	ACAA	2	8	7797	7804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020267	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020267	CAT	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020267	TAA	2	6	7993	7998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020267	TCT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020267	AG	3	6	8857	8862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020267	CTT	2	6	9239	9244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020267	TCT	2	6	9245	9250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020267	ATA	2	6	9251	9256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020267	TA	3	6	9286	9291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020267	TTAT	2	8	9310	9317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020267	T	6	6	10616	10621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020267	AAT	2	6	10629	10634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020267	TAA	2	6	10675	10680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020267	G	6	6	13524	13529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020267	TA	3	6	15019	15024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020267	A	6	6	15673	15678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020267	TTA	2	6	15693	15698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020267	TAT	2	6	15722	15727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020267	ATT	2	6	15758	15763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020267	AGA	2	6	15769	15774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020267	TAAT	2	8	15780	15787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020267	AAT	2	6	15807	15812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020267	A	7	7	16065	16071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.